Top > Back > 学術論文・プロシーディングス・著作 の検索結果 46 件中 1‐30 件目
Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Simulations for Chiral-Selective Aminoacylation: Unraveling the Nature of Life |
[ 全著者名 ] Tadashi Ando and Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] Computation |
[ 掲載年月 ] 2024年 12月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Time/Space and Inertial System Reconsidered Based on the Adaptive Dynamical View |
[ 全著者名 ] Tadashi Ando Ichiro Yamato |
[ 掲載誌名 ] Journal of Modern Physics |
[ 掲載年月 ] 2024年 10月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Binding characteristics of the doxepin E/Z-isomers to the histamine H1 receptor revealed by receptor-bound ligand analysis and molecular dynamics study |
[ 全著者名 ] Hiroto Kaneko, Ryunosuke Korenaga, Ryota Nakamura, Shinnosuke Kawai, Tadashi Ando, Mitsunori Shiroishi |
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF MOLECULAR RECOGNITION |
[ 掲載年月 ] 2024年 6月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Elucidation of productive alanine recognition mechanism by Escherichia coli alanyl-tRNA synthetase |
[ 全著者名 ] Mayu Onoguchi, Riku Otsuka, Miki Koyama, Tadashi Ando, Hiromi Mutsuro-Aoki, Takuya Umehara, Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] BIOSYSTEMS |
[ 掲載年月 ] 2024年 3月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Refinement of Adaptive Dynamical Simulation of Quantum Mechanical Double Slit Interference Phenomenon |
[ 全著者名 ] Tadashi Ando Andrei Khrennikov Ichiro Yamato |
[ 掲載誌名 ] Journal of Modern Physics |
[ 掲載年月 ] 2024年 2月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Adaptive Dynamics Simulation of Interference Phenomenon for Physical and Biological Systems |
[ 全著者名 ] Tadashi Ando Masanari Asano Andrei Khrennikov Takashi Matsuoka Ichiro Yamato |
[ 掲載誌名 ] Entropy |
[ 掲載年月 ] 2023年 10月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Shear viscosity of OPC and OPC3 water models |
[ 全著者名 ] Tadashi Ando |
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS |
[ 掲載年月 ] 2023年 9月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Molecular Anatomy of the Class I Ligase Ribozyme for Elucidation of the Activity-Generating Unit |
[ 全著者名 ] Miho Kasuga, Hiromi Mutsuro-Aoki, Tadashi Ando, and Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] Biology-Basel |
[ 掲載年月 ] 2023年 7月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Mechanism of Chiral-Selective Aminoacylation of an RNA Minihelix Explored by QM/MM Free-Energy Simulations |
[ 全著者名 ] Tadashi Ando Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] Life-Basel |
[ 掲載年月 ] 2023年 3月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
A 3D-Simulation and Experimental Study of the Fluid Flow Around a Nano-Step Structure Formed by UV-NIL |
[ 全著者名 ] Tadashi Ando, Yusei Honda, Tomoki Yanagawa, Noriyuki Unno, Jun Taniguchi, Shin-ichi Satake |
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF PHOTOPOLYMER SCIENCE AND TECHNOLOGY |
[ 掲載年月 ] 2023年 1月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Molecular Dynamics Study on Behavior of Resist Molecules in UV-Nanoimprint Lithography Filling Process |
[ 全著者名 ] Jun Iwata Tadashi Ando |
[ 掲載誌名 ] Nanomaterials |
[ 掲載年月 ] 2022年 7月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Peptide Bond Formation between Aminoacyl-Minihelices by a Scaffold Derived from the Peptidyl Transferase Center |
[ 全著者名 ] Mai Kawabata, Kentaro Kawashima, Hiromi Mutsuro-Aoki, Tadashi Ando, Takuya Umehara, Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] Life-Basel |
[ 掲載年月 ] 2022年 4月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Cooperative regulation of endocytic vesicle transport by yeast Eps15-like protein Pan1p and epsins |
[ 全著者名 ] Nao Yoshida Ippo Ogura Makoto Nagano Tadashi Ando Junko Y. Toshima Jiro Toshima |
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY |
[ 掲載年月 ] 2021年 11月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Crystal structure of Nanoarchaeum equitans tyrosyl-tRNA synthetase and its aminoacylation activity toward tRNATyr with an extra guanosine residue at the 5ʹ-terminus |
[ 全著者名 ] Horikoshi, T. Noguchi, H. Umehara, T. Mutsuro-Aoki, H. Kurihara, R. Noguchi, R. Hashimoto, T. Watanabe, Y. Ando, T. Kamata, K. Park, S. Y. Tamura, K. |
[ 掲載誌名 ] BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS |
[ 掲載年月 ] 2021年 10月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Molecular Dynamics Study of Resist Filling Process in UV-nanoimprint Lithography |
[ 全著者名 ] Hiroki Uchida, Ryosuke Imoto, Tadashi Ando, Takao Okabe, and Jun Taniguchi |
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF PHOTOPOLYMER SCIENCE AND TECHNOLOGY |
[ 掲載年月 ] 2021年 6月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Hi-CO: 3D genome structure analysis with nucleosome resolution |
[ 全著者名 ] Masae Ohno, Tadashi Ando, David G. Priest, Yuichi Taniguchi |
[ 掲載誌名 ] Nature Protocols |
[ 掲載年月 ] 2021年 5月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
The crystal structure of the tetrameric human vasohibin-1–SVBP complex reveals a variable arm region within the structural core |
[ 全著者名 ] Ikeda, Akihito and Urata, Seia and Ando, Tadashi and Suzuki, Yasuhiro and Sato, Yasufumi and Nishino, Tatsuya |
[ 掲載誌名 ] Acta Crystallographica Section D-Structural Biology |
[ 掲載年月 ] 2020年 10月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
G:U-Independent RNA Minihelix Aminoacylation by Nanoarchaeum equitans Alanyl-tRNA Synthetase: An Insight into the Evolution of Aminoacyl-tRNA Synthetases |
[ 全著者名 ] Misa Arutaki, Ryodai Kurihara, Toru Matsuoka, Ayako Inami, Kei Tokunaga, Tomomasa Ohno, Hiroki Takahashi, Haruka Takano, Tadashi Ando, Hiromi Mutsuro-Aoki, Takuya Umehara & Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION |
[ 掲載年月 ] 2020年 5月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
RNA aptamers for a tRNA-binding protein from aeropyrum pernix with homologous counterparts distributed throughout evolution |
[ 全著者名 ] Senri Ohmori, Marina Wani, Saki Kitabatake, Yuka Nakatsugawa, Tadashi Ando, Takuya Umehara and Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] Life |
[ 掲載年月 ] 2020年 2月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Glycyl-tRNA synthetase from Nanoarchaeum equitans: The first crystal structure of archaeal GlyRS and analysis of its tRNA glycylation |
[ 全著者名 ] Alma Fujisawa, Risako Toki, Hideaki Miyake, Tomoko Shoji, Hiromi Doi, Hiromi Hayashi, Rina Hanabusa, Hiromi Mutsuro-Aoki, Takuya Umehara, Tadashi Ando, Hiroki Noguchi, Arnout Voet, Sam-Yong Park, Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS |
[ 掲載年月 ] 2019年 4月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Sub-nucleosomal Genome Structure Reveals Distinct Nucleosome Folding Motifs |
[ 全著者名 ] Masae Ohno Tadashi Ando David G. Priest Vipin Kumar Yamato Yoshida Yuichi Taniguchi |
[ 掲載誌名 ] CELL |
[ 掲載年月 ] 2019年 1月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Principles of chemical geometry underlying chiral selectivity in RNA minihelix aminoacylation |
[ 全著者名 ] Tadashi Ando, Shunichi Takahashi, Koji Tamura |
[ 掲載誌名 ] NUCLEIC ACIDS RESEARCH |
[ 掲載年月 ] 2018年 11月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
GENESIS 1.1: A hybrid-parallel molecular dynamics simulator with enhanced sampling algorithms on multiple computational platforms |
[ 全著者名 ] Kobayashi, C. Jung, J. Matsunaga, Y. Mori, T. Ando, T. Tamura, K. Kamiya, M. Sugita, Y. |
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY |
[ 掲載年月 ] 2017年 9月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Biomolecular interactions modulate macromolecular structure and dynamics in atomistic model of a bacterial cytoplasm |
[ 全著者名 ] Yu, I. Mori, T. Ando, T. Harada, R. Jung, J. Sugita, Y. Feig, M. |
[ 掲載誌名 ] eLife |
[ 掲載年月 ] 2016年 11月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Thermodynamics of Macromolecular Association in Heterogeneous Crowding Environments: Theoretical and Simulation Studies with a Simplified Model |
[ 全著者名 ] Ando, T. Yu, I. Feig, M. Sugita, Y. |
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B |
[ 掲載年月 ] 2016年 10月 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
DNA double-strand breaks alter the spatial arrangement of homologous loci in plant cells |
[ 全著者名 ] Hirakawa, Takeshi Katagiri, Yohei Ando, Tadashi Matsunaga, Sachihiro |
[ 掲載誌名 ] Scientific Reports |
[ 掲載年月 ] 2015年 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Left-right asymmetry is formed in individual cells by intrinsic cell chirality |
[ 全著者名 ] Hatori, Ryo Ando, Tadashi Sasamura, Takeshi Nakazawa, Naotaka Nakamura, Mitsutoshi Taniguchi, Kiichiro Hozumi, Shunya Kikuta, Junichi Ishii, Masaru Matsuno, Kenji |
[ 掲載誌名 ] MECHANISMS OF DEVELOPMENT |
[ 掲載年月 ] 2014年 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Sliding of Proteins Non-specifically Bound to DNA: Brownian Dynamics Studies with Coarse-Grained Protein and DNA Models |
[ 全著者名 ] Ando, Tadashi Skolnick, Jeffrey |
[ 掲載誌名 ] PLoS Computational Biology |
[ 掲載年月 ] 2014年 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
Ion Selectivity Mechanism of Escherichia Coli OmpF Porin: a Molecular Dynamics Simulation/ free Energy Calculation Study |
[ 全著者名 ] Matsuura, Yasuhiro Yamato, Ichiro Ando, Tadashi Suenaga, Atsushi |
[ 掲載誌名 ] Journal of Computer Chemistry, Japan |
[ 掲載年月 ] 2014年 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語) |
生化学データに基づくシステムシミュレータの開発 ―大腸菌二段階増殖のシミュレーション― |
[ 全著者名 ] Ando, Tadashi Itoh, Seigo Yamato, Ichiro |
[ 掲載誌名 ] Journal of Computer Chemistry, Japan |
[ 掲載年月 ] 2013年 |
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(日本語) |