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Krylov subspace methods for computing hydrodynamic interactions in Brownian dynamics simulations
[ 全著者名 ] Ando, Tadashi Chow, Edmond Saad, Yousef Skolnick, Jeffrey
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS
[ 掲載年月 ] 2012年
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Alanine-based peptides containing polar residues presumably favour A-helical structure entropically
[ 全著者名 ] Kim, Wankee Yamato, Ichiro Ando, Tadashi
[ 掲載誌名 ] Molecular Simulation
[ 掲載年月 ] 2011年 4月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Role of Asp187 and Gln190 in the Na+/proline symporter (PutP) of Escherichia coli
[ 全著者名 ] Amin, Anowarul Ando, Tadashi Saijo, Shinya Yamato, Ichiro
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF BIOCHEMISTRY
[ 掲載年月 ] 2011年
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Chirality in planar cell shape contributes to left-right asymmetric epithelial morphogenesis
[ 全著者名 ] Taniguchi, Kiichiro Maeda, Reo Ando, Tadashi Okumura, Takashi Nakazawa, Naotaka Hatori, Ryo Nakamura, Mitsutoshi Hozumi, Shunya Fujiwara, Hiroo Matsuno, Kenji
[ 掲載誌名 ] SCIENCE
[ 掲載年月 ] 2011年
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Crowding and hydrodynamic interactions likely dominate in vivo macromolecular motion.
[ 全著者名 ] Ando, Tadashi Skolnick, Jeffrey
[ 掲載誌名 ] PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
[ 掲載年月 ] 2010年
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
分子動力学/自由エネルギー計算によるF-ATPase触媒部位への基質結合親和性の算出
[ 全著者名 ] Suenaga, Atsushi Umezu, Osamu Ando, Tadashi Yamato, Ichiro Murata, Takeshi Taiji, Makoto
[ 掲載誌名 ] Journal of Computer Chemistry, Japan
[ 掲載年月 ] 2008年
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(日本語)
膜タンパク質ブラウン動力学シミュレーション法の開発
[ 全著者名 ] 金 完起, 伊藤 隆宏, 山登 一郎, 安藤 格士
[ 掲載誌名 ] Journal of Computer Chemistry, Japan
[ 掲載年月 ] 2007年 9月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(日本語)
Free energy landscapes of two model peptides: α-helical and β-hairpin peptides explored with Brownian dynamics simulation
[ 全著者名 ] Tadashi Ando and Ichiro Yamato
[ 掲載誌名 ] Molecular Simulation
[ 掲載年月 ] 2005年 8月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
FCANAL:Structure based protein function prediction method. Application to enzymes and binding proteins
[ 全著者名 ] Ayumi Suzuki,Tadashi Ando,Ichiro Yamato,and Satoru Miyazaki
[ 掲載誌名 ] Chemo-Bio Informatics Journal
[ 掲載年月 ] 2005年
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
A new implicit solvent model for Brownian dynamics simulation: Solvent-accessible surface area dependent effective charge model
[ 全著者名 ] Tadashi ANDO, Toshiyuki MEGURO and Ichiro YAMATO
[ 掲載誌名 ] Journal of Computer Chemistry, Japan
[ 掲載年月 ] 2004年 10月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Multiple Time Step Brownian Dynamics for Long Time Simulation of Biomolecules
[ 全著者名 ] TADASHI ANDO, YOSHIYUKI MEGURO and ICHIRO YAMATO
[ 掲載誌名 ] Molecular Simulation
[ 掲載年月 ] 2003年 6月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Development of Multifunctional Object-Oriented Program Library for Molecular Simulation and Structure Analysis
[ 全著者名 ] Toshiyuki MEGURO, Tadashi ANDO and Ichiro YAMATO
[ 掲載誌名 ] Journal of Computer Chemistry, Japan
[ 掲載年月 ] 2003年 3月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Development of a structure based protein function prediction method: Calcium binding protein
[ 全著者名 ] Takeo Asaoka, Tadashi Ando, Toshiyuki Meguro and Ichiro Yamato
[ 掲載誌名 ] Chem-Bio Informatics Journal
[ 掲載年月 ] 2003年 1月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Development of an Atomistic Brownian Dynamics Algorithm with Implicit Solvent Model for Long Time Simulation
[ 全著者名 ] Tadashi ANDO, Toshiyuki MEGURO and Ichiro YAMATO
[ 掲載誌名 ] Journal of Computer Chemistry, Japan
[ 掲載年月 ] 2002年 9月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
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