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Crystal structure of Nanoarchaeum equitans tyrosyl-tRNA synthetase and its aminoacylation activity toward tRNATyr with an extra guanosine residue at the 5ʹ-terminus
[ 全著者名 ] Tatsuya Horikoshi, Hiroki Noguchi, Takuya Umehara, Hiromi Mutsuro-Aoki, Ryodai Kurihara, Ryohei Noguchi, Takahiro Hashimoto, Yuki Watanabe, Tadashi Ando, Kenichi Kamata, Sam-Yong Park, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
[ 掲載年月 ] 2021年 10月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Amino acid activation analysis of primitive aminoacyl-tRNA synthetases encoded by both strands of a single gene using the malachite green assay
[ 全著者名 ] Kazaha Onodera, Nana Suganuma, Haruka Takano, Yu Sugita, Tomoko Shoji, Ayaka Minobe, Narumi Yamaki, Riku Otsuka, Hiromi Mutsuro-Aoki, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOSYSTEMS
[ 掲載年月 ] 2021年 10月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Identification of Two Critical Neutralizing Epitopes in the Receptor Binding Domain of Hepatitis B Virus preS1
[ 全著者名 ] Keigo Yato, Taishi Onodera, Mami Matsuda, Saya Moriyama, Akira Fujimoto, Koichi Watashi, Hideki Aizaki, Tomohisa Tanaka, Kohji Moriishi, Hironori Nishitsuji, Kunitada Shimotohno, Koji Tamura, Yoshimasa Takahashi, Takaji Wakita, Masamichi Muramatsu, Takanobu Kato, Ryosuke Suzuki
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF VIROLOGY
[ 掲載年月 ] 2021年 2月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Aminoacylation of short hairpin RNAs through kissing-loop interactions indicates evolutionary trend of RNA molecules
[ 全著者名 ] Hiromi Mutsuro-Aoki, Kokoro Hamachi, Ryodai Kurihara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOSYSTEMS
[ 掲載年月 ] 2020年 11月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
G:U‐Independent RNA Minihelix Aminoacylation by Nanoarchaeum equitans Alanyl‐tRNA Synthetase: An Insight into the Evolution of Aminoacyl‐tRNA Synthetases
[ 全著者名 ] Misa Arutaki, Ryodai Kurihara, Toru Matsuoka, Ayako Inami, Kei Tokunaga, Tomomasa Ohno, Hiroki Takahashi, Haruka Takano, Tadashi Ando, Hiromi Mutsuro‐Aoki, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION
[ 掲載年月 ] 2020年 8月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
RNA Aptamers for a tRNA-Binding Protein from Aeropyrum pernix with Homologous Counterparts Distributed Throughout Evolution
[ 全著者名 ] Senri Ohmori, Marina Wani, Saki Kitabatake, Yuka Nakatsugawa, Tadashi Ando, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] Life
[ 掲載年月 ] 2020年 2月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Perspectives on the Origin of Biological Homochirality on Earth
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] J MOL EVOL
[ 掲載年月 ] 2019年 7月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Glycyl-tRNA synthetase from Nanoarchaeum equitans: The first crystal structure of archaeal GlyRS and analysis of its tRNA glycylation
[ 全著者名 ] Alma Fujisawa, Risako Toki, Hideaki Miyake, Tomoko Shoji, Hiromi Doi, Hiromi Hayashi, Rina Hanabusa, Hiromi Mutsuro-Aoki, Takuya Umehara, Tadashi Ando, Hiroki Noguchi, Arnout Voet, Sam-Yong Park, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOCHEM BIOPH RES CO
[ 掲載年月 ] 2019年 4月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Effects of complementary loop composition in truncated R3C ligase ribozymes on kiss switch activation
[ 全著者名 ] Kokoro Hamachi, Hiromi Mutsuro-Aoki, Kana Tanizawa, Ito Hirasawa, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOSYSTEMS
[ 掲載年月 ] 2019年 3月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Principles of chemical geometry underlying chiral selectivity in RNA minihelix aminoacylation
[ 全著者名 ] Tadashi Ando, Shunichi Takahashi, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] NUCLEIC ACIDS RES
[ 掲載年月 ] 2018年 11月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Lysine acetylation regulates alanyl-tRNA synthetase activity in Escherichia coli
[ 全著者名 ] Takuya Umehara, Saori Kosono, Dieter Söll, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] Genes
[ 掲載年月 ] 2018年 9月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
The Kiss Switch Brings Inactive R3C Ligase Ribozyme Back to Life
[ 全著者名 ] Kana Tanizawa, Sayuri Uchida, Eri Kurihara, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOLOGY
[ 掲載年月 ] 2018年 1月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
A step into the RNA world: Conditional analysis of hydrogel formationof adenosine 5'-monophosphate induced by cyanuric acid
[ 全著者名 ] Takumi Yokosawa, Ryota Enomoto, Sho Uchino, Ito Hirasawa, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOSYSTEMS
[ 掲載年月 ] 2017年 9月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Binding Properties of Split tRNA to the C-terminal Domain of Methionyl-tRNA Synthetase of Nanoarchaeum equitans
[ 全著者名 ] Hidemichi Suzuki, Akihiro Kaneko, Taro Yamamoto, Mahoko Nambo, Ito Hirasawa, Takuya Umehara, Hisashi Yoshida, Sam-Yong Park, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] J MOL EVOL
[ 掲載年月 ] 2017年 6月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
The Genetic Code: Francis Crick's Legacy and Beyond
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] Life
[ 掲載年月 ] 2016年 8月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Toward the 'new century' of handedness in biology: In commemoration of the 100th anniversary of the birth of Francis Crick
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] J BIOSCIENCES
[ 掲載年月 ] 2016年 6月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Origins and Early Evolution of the tRNA Molecule
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] Life
[ 掲載年月 ] 2015年 12月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Beyond the frozen accident: Glycine assignment in the genetic code
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] J MOL EVOL
[ 掲載年月 ] 2015年 10月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
RNA evolution conjectured from tRNA and riboswitches
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] Hypothesis
[ 掲載年月 ] 2015年 5月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Development of a functionally minimized mutant of the R3C ligase ribozyme offers insight into the plausibility of the RNA world hypothesis
[ 全著者名 ] Eri Kurihara, Sayuri Uchida, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOLOGY
[ 掲載年月 ] 2014年 9月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Proline might have been the first amino acid in the primitive genetic code
[ 全著者名 ] Reina Komatsu, Risa Sawada, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] J MOL EVOL
[ 掲載年月 ] 2014年 6月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Glycols modulate terminator stem stability and ligand-dependency of a glycine riboswitch
[ 全著者名 ] Kokoro Hamachi, Hikari Hayashi, Miyuki Shimamura, Yuiha Yamaji, Ai Kaneko, Aruma Fujisawa, Takuya Umehara, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOSYSTEMS
[ 掲載年月 ] 2013年 8月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
RNA tetraplex as a primordial peptide synthesis scaffold
[ 全著者名 ] Takuya Umehara, Takahiro Kitagawa, Yu Nakazawa, Hinako Yoshino, Ryohei Nemoto, Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] BIOSYSTEMS
[ 掲載年月 ] 2012年 8月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Ribosome evolution: Emergence of peptide synthesis machinery
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] J BIOSCIENCES
[ 掲載年月 ] 2011年 12月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Mechanistic features of RNA-directed molecular asymmetry of amino acids
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] VIVA ORIGINO
[ 掲載年月 ] 2011年 9月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(日本語)
Origin of the peptide-forming function in the ribosome
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] VIVA ORIGINO
[ 掲載年月 ] 2011年 9月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(日本語)
Molecular Basis for Chiral Selection in RNA Aminoacylation
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
[ 掲載年月 ] 2011年 7月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
Peptide Bond Formation: RNA's Big Bang
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] JOURNAL OF COSMOLOGY
[ 掲載年月 ] 2011年 3月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(外国語)
RNA-directed molecular asymmetry of amino acids
[ 全著者名 ] Koji Tamura
[ 掲載誌名 ] VIVA ORIGINO
[ 掲載年月 ] 2010年 12月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(日本語)
アミノ酸の非対称性の起源:RNAワールドの観点から
[ 全著者名 ] 田村浩二
[ 掲載誌名 ] 生物物理
[ 掲載年月 ] 2010年 8月
[ 著作区分 ] レフェリー付学術論文(日本語)
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